染色质免疫共沉淀简介
染色质免疫共沉淀(ChIP)是一类通过将于特定蛋白质与其结合的DNA序列共同沉淀下来研究其相互作用的方法。基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。ChIP能真实、完整地反映结合在DNA序列上的调控蛋白,是目前确定与特定蛋白结合的基因组区域或确定与特定基因组区域结合的蛋白质的一种很好的方法。ChIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。
依托第二代测序技术并联合染色质免疫共沉淀技术的优势(将染色质免疫共沉淀技术与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,充分发挥了二者的优势,能够高效地在全基因组范围内研究目的蛋白的结合位点,形成了新的ChIP-Seq技术。ChIP-Seq的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。
华因康基因ChIP-Seq测序技术
- 采用Pstar 系列高通量基因测序仪
技术特点
- 免疫共沉淀技术与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,充分发挥了二者的优势。
- 通量高,实时监测测序动态;
- 测序深度大,每个碱基有50-300以上的重复。
- 时间周期:30~45个工作日。
样品要求
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OD260/280=1.7~2.0,样品总量≥ 5 ug;
请提供样品的体积、浓度、制备时间、溶剂名称及来源等具体信息。同时请附上相关QC数据,包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。